L'I.T.I.S. "Modesto Panetti" è ubicato in via Re David 186  a pochi minuti di marcia dalla Stazione Centrale della città di Bari.

La scuola è ben collegata con il resto della città per mezzo di numerose linee AMTAB e con la provincia attraverso le Ferrovie dello Stato e i bus delle linee di trasporto provinciale.

L'Istituto gode di una posizione strategica a ridosso del Campus Universitario e del Politecnico, oltre ad essere confinante con numerose scuole primarie e secondarie.